ANALISIS IN SILICO SENYAWA POLIFENOL DAUN ALPUKAT (Persea americana Mill.) SEBAGAI POTENSI INHIBITOR SGLT-2 MENGGUNAKAN MOLECULAR DOCKING DAN PREDIKSI ADMET
Abstract
Diabetes melitus tipe 2 menjadi ancaman kesehatan global yang signifikan dengan prevalensi mencapai 562 juta jiwa pada tahun 2025 dan diperkirakan meningkat menjadi 853 juta kasus pada tahun 2050. Terapi yang tersedia saat ini masih memiliki berbagai keterbatasan dan efek samping seperti infeksi saluran kemih dan resiko ketoasidosis euglikemik. Daun alpukat (Persea americana Mill.) diketahui mengandung berbagai senyawa polifenol yang berpotensi sebagai antidiabetes melalui mekanisme penghambatan Sodium glucose cotransporters 2 (SGLT-2). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis aktivitas penghambatan senyawa polifenol daun alpukat terhadap protein SGLT 2 dengan pemanfaatan CAAD melalui molecular docking dan prediksi sifat ADMET.
Penelitian menggunakan desain eksperimental berbasis komputer terhadap 30 senyawa polifenol daun alpukat dengan empagliflozin sebagai kontrol positif dan parasetamol sebagai kontrol negatif. Analisis dilakukan menggunakan perangkat lunak ChemDraw, VegaZZ, DSV, PyRx, PyMOL, SwissADME, dan Toxtree.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa Syringic acid merupakan senyawa terbaik dengan RMSD 1,274 dan ΔG −6,4, ikatan residu asam amino spesifik dengan empaglifozin, memenuhi kriteria Lipinski’s Rule of Five, dan dalam kategori toksisitas rendah (class I) berdasarkan cramer rules. Sehingga dapat disimpulkan bahwa senyawa polifenol daun alpukat (Persea americana Mill.) menunjukkan potensi sebagai inhibitor SGLT-2 dengan syringic acid sebagai kandidat terbaik (ΔG −6,4 kkal/mol; RMSD 1,274 Å).
References
Baroroh, U., Biotek, M., Muscifa, Z.S., Destiarani, W., Rohmatullah, F.G. dan Yusuf, M., 2023. Molecular interaction analysis and visualization of proteinligand docking using Biovia Discovery Studio Visualizer. Indonesian Journal of Computational Biology (IJCB), 2(1), pp.22-30.
Bhujade, P.R., Shedame, K.G., Hatwar, P.R., Bakal, R.L., Nehar, K.N. and Gawai, A.Y., 2024. A Review on Computer Aided Drug Design in Silico. Asian Journal of Pharmaceutical Research and Development, 12(6), pp.80-85.
Bhupal, R. and Asati, V., 2022. In Silico Studies for The Identification of Potential SGLT2 Inhibitors. Pharmaspire, 14, pp.135-140.
Cornelissen, F.M., Markert, G., Deutsch, G., Antonara, M., Faaij, N., Bartelink, I., Noske, D., Vandertop, W.P., Bender, A. dan Westerman, B.A., 2023. Explaining blood–brain barrier permeability of small molecules by integrated analysis of different transport mechanisms. Journal of Medicinal Chemistry, 66(11), pp.7253-7267.
Gliozzi, M., Macrì, R., Coppoletta, A.R., Musolino, V., Carresi, C., Scicchitano, M., Bosco, F., Guarnieri, L., Cardamone, A., Ruga, S. and Scarano, F., 2022. From Diabetes Care to Heart Failure Management: A Potential Therapeutic Approach Combining SGLT2 Inhibitors and Plant Extracts. Nutrients, 14(18), p.3737.
Halder, S.K., Sultana, I., Shuvo, M.N., Shil, A., Himel, M.K., Hasan, M.A. and Shawan, M.M.A.K., 2023. In Silico Identification and Analysis of Potentially Bioactive Antiviral Phytochemicals against SARS‐CoV‐2: A Molecular Docking and Dynamics Simulation Approach. BioMed Research International, 2023(1), p.5469258.
Lee, D.H., Kim, J.W., Cong, R., Park, J.S., Nguyen, C.H.B., Park, K., Kang, K. and Shim, S.M., 2025. Exploring absorption indices for a variety of polyphenols through Caco‐2 cell model: insights from permeability studies and principal component analysis. Journal of the Science of Food and Agriculture.
Listyani, T.A. dan Azizah, D., 2025. ANALISIS DOCKING MOLEKULER BESERTA PREDIKSI ADME DERIVAT FLAVONOID SENYAWA KOMPOSISI KIMIA EKSTRAK BUNGA ROSELA (Hisbiscus Sabdariffa L.) SEBAGAI ANTIOBESITAS. Duta Pharma Journal, 5(2), pp.141-158.
Manno, M.R. and Utami, D., 2023. SENYAWA AKTIF KELAUTAN INDONESIA SEBAGAI INHIBITOR PROTEASE UTAMA SARS-CoV-2: STUDI DOCKING MOLEKULER. Jurnal Ilmiah Farmasi, 19(2), pp.182-194.
Patlewicz, G., Wambaugh, J.F., Felter, S.P., Simon, T.W. dan Becker, R.A., 2018. Utilizing threshold of toxicological concern (TTC) with high throughput exposure predictions (HTE) as a risk-based prioritization approach for thousands of chemicals. Computational Toxicology, 7, pp.58-67.
Pratama, A.B., Herowati, R. and Ansory, H.M., 2021. Studi Docking Molekuler Senyawa dalam Minyak Atsiri Pala (Myristica fragrans H.) dan Senyawa Turunan Miristisin Terhadap Target Terapi Kanker Kulit. Majalah Farmaseutik, 17(2), pp.233-242.
Rahmadhita, E., Iqbal, M., Oktoba, Z., Nurmasuri, N. and Triyandi, R., 2024. Review Artikel: Aktivitas Farmakologi Daun Alpukat (Persea americana Mill.). Medical Profession Journal of Lampung, 14(7), pp.1249-1252.
Ramani, J., Shah, H., Vyas, V.K. and Sharma, M., 2022. A Review on The Medicinal Chemistry of Sodium Glucose Co-Transporter 2 Inhibitors (SGLT2- I): Update from 2010 to present. European Journal of Medicinal Chemistry Reports, 6, p.100074.
Riyadi, P.H., Sari, I.D., Kurniasih, R.A., Agustini, T.W., Swastawati, F., Herawati, V.E. dan Tanod, W.A., 2021. SwissADME predictions of pharmacokinetics and drug-likeness properties of small molecules present in Spirulina platensis. In IOP conference series: earth and environmental science (Vol. 890, No. 1, p. 012021). IOP Publishing.
Shashank, M., Manu, G., ramya, C., rajashekhara, S., Sudhanva, M. and Saravanan P.R.R., 2025. Exploring Jackfruit Flour Polyphenols as Promising SGLT-2 Inhibitors for Hyperglycemia Management. Int J App Pharm, 17(1), pp.199-208.
Singh, K., Tarapcsák, S., Gyöngy, Z., Ritter, Z., Batta, G., Bosire, R., Remenyik, J. and Goda, K., 2021. Effects of polyphenols on P-glycoprotein (ABCB1) activity. Pharmaceutics, 13(12), p.2062.
Copyright (c) 2026 Rahardian Ariana Putri, Tiara Ajeng Listyani, Danang Raharjo (Author)
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
